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Natamycin ist ein natürlich vorkommendes Makrolid-Polyen-Antimykotikum, das während der Fermentation durch das Bakterium S. natalensis produziert wird, das häufig im Boden vorkommt.
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Natamycin, das aus Streptomyces nataIensis und Streptomyces chat tanoogensis gewonnen wird, wird zur Bekämpfung von Krankheiten bei Blumenzwiebeln eingesetzt. Mit minimalen Hemmkonzentrationen von 4 bis 64 µM wird Natamycin zur Behandlung von Pilzinfektionen eingesetzt, darunter Candida, Aspergillus, Cephalosporium, Fusarium und Penicillium. Natamycin blockiert das Pilzwachstum, indem es spezifisch an Ergosterol mit einer offensichtlichen Affinität von ~100 µM bindet, aber die Zellmembranen nicht permeabilisiert, wie dies bei anderen Polyen-Antibiotika der Fall ist. Natamycin wird auch in der Lebensmittelindustrie als Konservierungsmittel verwendet. Neben der therapeutischen und lebensmitteltechnischen Verwendung wird Natamycin auch als Agrarchemikalie und Holzschutzmittel eingesetzt.